Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms