Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms