Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K1

Sbk2, Serine/threonine-protein kinase SBK2, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk2P0C5K1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk2P0C5K1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk2P0C5K1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk2P0C5K1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms