Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoeP08226 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms