Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms