Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9P06683 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9P06683 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9P06683 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9P06683 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9P06683 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9P06683 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9P06683 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9P06683 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P06683 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P06683 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P06683 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P06683 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P06683 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P06683 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P06683 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P06683 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P06683 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P06683 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P06683 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P06683 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P06683 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P06683 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P06683 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P06683 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P06683 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P06683 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P06683 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P06683 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P06683 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P06683 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P06683 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P06683 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P06683 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms