Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06321 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06321 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06321 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06321 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06321 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06321 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06321 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P06321 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06321 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06321 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06321 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06321 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06321 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06321 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06321 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms