Protein–RNA interactions for Protein: P04945

Ig kappa chain V-VI region NQ2-6.1, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04945 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04945 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04945 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04945 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04945 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04945 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P04945 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04945 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04945 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04945 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04945 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04945 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04945 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04945 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04945 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04945 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04945 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04945 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04945 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04945 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04945 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04945 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04945 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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P04945 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04945 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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