Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrygdP04342 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrygdP04342 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrygdP04342 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrygdP04342 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrygdP04342 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrygdP04342 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrygdP04342 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrygdP04342 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrygdP04342 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrygdP04342 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrygdP04342 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrygdP04342 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrygdP04342 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CrygdP04342 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms