Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GzmbP04187 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GzmbP04187 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GzmbP04187 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GzmbP04187 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GzmbP04187 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GzmbP04187 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GzmbP04187 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GzmbP04187 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms