Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt1P04104 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt1P04104 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms