Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01790 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01790 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01790 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01790 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01790 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01790 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01790 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01790 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01790 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01790 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01790 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01790 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01790 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms