Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01746 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01746 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01746 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01746 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01746 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01746 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01746 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01746 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01746 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01746 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01746 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01746 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01746 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01746 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01746 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01746 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01746 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01746 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01746 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01746 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01746 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01746 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01746 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms