Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms