Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms