Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CcnkO88874 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnkO88874 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CcnkO88874 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CcnkO88874 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms