Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms