Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Parp2O88554 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Parp2O88554 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Parp2O88554 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Parp2O88554 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Parp2O88554 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Parp2O88554 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Parp2O88554 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Parp2O88554 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Parp2O88554 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms