Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms