Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CntfrO88507 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CntfrO88507 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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