Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nid2O88322 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nid2O88322 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nid2O88322 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid2O88322 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid2O88322 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nid2O88322 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nid2O88322 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nid2O88322 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms