Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms