Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms