Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms