Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms