Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1bO55017 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms