Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms