Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NlkO54949 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NlkO54949 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NlkO54949 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NlkO54949 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NlkO54949 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NlkO54949 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NlkO54949 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NlkO54949 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms