Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Socs5O54928 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Socs5O54928 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Socs5O54928 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Socs5O54928 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Socs5O54928 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Socs5O54928 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Socs5O54928 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms