Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DffbO54788 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DffbO54788 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffbO54788 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffbO54788 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DffbO54788 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DffbO54788 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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