Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Limk2O54785 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limk2O54785 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms