Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd2O35927 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms