Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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