Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms