Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KeraO35367 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KeraO35367 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KeraO35367 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KeraO35367 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KeraO35367 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KeraO35367 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KeraO35367 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KeraO35367 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KeraO35367 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KeraO35367 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KeraO35367 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms