Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kpna3O35344 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms