Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms