Protein–RNA interactions for Protein: O35295

Purb, Transcriptional activator protein Pur-beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PurbO35295 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PurbO35295 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PurbO35295 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PurbO35295 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PurbO35295 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PurbO35295 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PurbO35295 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PurbO35295 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PurbO35295 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PurbO35295 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PurbO35295 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PurbO35295 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PurbO35295 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PurbO35295 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PurbO35295 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PurbO35295 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PurbO35295 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PurbO35295 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PurbO35295 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PurbO35295 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PurbO35295 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PurbO35295 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PurbO35295 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PurbO35295 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PurbO35295 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PurbO35295 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PurbO35295 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PurbO35295 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PurbO35295 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PurbO35295 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PurbO35295 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PurbO35295 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PurbO35295 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PurbO35295 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PurbO35295 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PurbO35295 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PurbO35295 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms