Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f3O35261 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f3O35261 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f3O35261 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f3O35261 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f3O35261 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f3O35261 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f3O35261 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f3O35261 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f3O35261 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f3O35261 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f3O35261 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms