Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Nedd9O35177 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Nedd9O35177 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Nedd9O35177 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Nedd9O35177 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Nedd9O35177 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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