Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms