Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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