Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp35M0QWN7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp35M0QWN7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Usp35M0QWN7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Usp35M0QWN7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp35M0QWN7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp35M0QWN7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp35M0QWN7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Usp35M0QWN7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Usp35M0QWN7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp35M0QWN7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Usp35M0QWN7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Usp35M0QWN7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp35M0QWN7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp35M0QWN7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp35M0QWN7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp35M0QWN7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp35M0QWN7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp35M0QWN7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp35M0QWN7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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