Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17078M0QW51 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms