Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8050L7N2E3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms