Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r80L7N1Z3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms