Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IfnabL7MTU6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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