Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm8888J3QPX5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm8888J3QPX5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm8888J3QPX5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm8888J3QPX5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm8888J3QPX5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm8888J3QPX5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8888J3QPX5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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