Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms