Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm19965J3QNY8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms